Je pense avoir fait le tour des alternatives Acrobat reader... j'ai adopté celui-ci.

Les possibiltés d'annotation d'un PDF sont incroyable dans sa version gratuite
- Texte façon machine à écrire
- surlignage, barré, sous ligné
- pavé de texte (permettant de choisir police, taille de caractère, gras, etc...) ;)
- fléches, bulles, formes
- hyperliens
- ...

A noter les propriétés bordure, surface et transparence sur nombre d'objet.
A noter également le clique droit sur des mots sélectionnés (... entre autres une recherche direct sur la toile ;))
De plus, la quasi totalité des annotations ne provoque pas l'apparition du logo sur le document enregistré en version free... cela ne concerne que des fonctions spécifiques et avancées